توضیحات
ABSTRACT
The Mycobacterium tuberculosis Complex (MTBC) consists of a clonal group of several mycobacterial lineages pathogenic to a range of different mammalian hosts. In this chapter, we discuss the origins and the evolutionary forces shaping the genomic diversity of the human-adapted MTBC. Advances in whole-genome sequencing have brought invaluable insights into the macro-evolution of the MTBC, and the biogeographical distribution of the different MTBC lineages, the phylogenetic relationships between these lineages. Moreover, micro-evolutionary processes start to be better understood, including those influencing bacterial mutation rates and those governing the fate of new mutations emerging within patients during treatment. Current genomic and epidemiological evidence reflect the fact that, through ecological specialization, the MTBC affecting humans became an obligate and extremely well-adapted human pathogen. Identifying the adaptive traits of human-adapted MTBC and unraveling the bacterial loci that interact with human genomic variation might help identify new targets for developing better vaccines and designing more effective treatments.
INTRODUCTION
Tuberculosis (TB) has affected human populations since ancient times. In the nineteenth century, TB was recognized as a contagious illness and its etiologic agent, the bacillus Mycobac- terium tuberculosis, was identified by Robert Koch in 1882. At that time, TB was a common cause of mortality in Europe and North America, causing 20–25% of all adult deaths (Stead 2001). Since the mid-1920s, TB rates have decreased dramatically in the developed world. However, TB is still among the ten top causes of death in many parts of the developing world (WHO 2016). In 2015, the World Health Organization (WHO) estimated 10.4 million new TB cases globally and 1.8 million deaths, making TB the number one cause of human death due to a single infectious agent (WHO 2016). The number of people carrying latent infections is estimated at 1.7 billion worldwide, urging for new diagnostic tools, better vaccines and new treatment regimens to control TB (Houben and Dodd 2016). Much of the TB epidemic, especially in sub-Saharan Africa, is driven by co- infection with the human immunodeficiency virus (HIV), which accounted for 1.2 million of all new TB cases in 2015 (WHO 2016). Moreover, 480,000 cases were estimated to be caused by multidrug-resistant TB (MDR-TB), posing additional challenges for diagnosis and treatment (see Chaps. 12 and 14 of this book).
چکیده
Complex of Mycobacterium tuberculosis (MTBC) شامل یک گروه کلونال چندین گونه میکاکوباکتریایی است که به یک دسته از میزبان های مختلف پستاندار بیماریزا هستند. در این فصل، ما در مورد ریشه ها و نیروهای تکاملی شکل دهی تنوع ژنتیکی MTBC انطباق پذیرفته شده با انسان را مورد بحث قرار می دهیم. پیشرفت در توالی کامل ژنوم، بینش ارزشمندی را در تکامل کلان MTBC و توزیع بیوگرافی پراکنش MTBC های مختلف، روابط فیلوژنتیکی بین این خطوط به ارمغان آورده است. علاوه بر این، فرآیندهای میکرو تکامل نیز بهتر می شود، از جمله کسانی که بر میزان جهش های باکتریایی تاثیر می گذارد و کسانی که سرنوشت جهش های جدیدی که در طی بیماران در حال رخ دادن هستند را در بر می گیرد. شواهد ژنومیک و اپیدمیولوژیک کنونی نشان دهنده این واقعیت است که از طریق تخصص بوم شناختی، MTBC که بر انسان تاثیر می گذارد، تبدیل به یک پاتوژن انسانی و سازگار با انسانی است. شناسایی ویژگی های سازگار MTBC انطباق پذیرفته شده با انسانی و برطرف کردن لک های باکتریایی که با تغییرات ژنتیکی انسان ارتباط برقرار می کنند ممکن است به تعیین اهداف جدید برای ایجاد واکسن های بهتر و طراحی درمان های موثر کمک کند.
مقدمه
Tuberculosis (TB) از زمان های قدیم انسان ها را تحت تاثیر قرار داده است. در قرن نوزدهم سل TB به عنوان یک بیماری مسری شناخته شد و عامل آن، باسیل Mycobacterium tuberculosis، توسط رابرت کخ در سال 1882 شناسایی شد. در آن زمان، TB یک علت شایع در مرگ و میر در اروپا و آمریکای شمالی بود، و باعث شد 20 تا 25 درصد از کل مرگ و میر بزرگسالان (Stead 2001). از اواسط دهه 1920، میزان TB در کشورهای توسعه یافته به طور چشمگیری کاهش یافته است. با این حال، سل باقی مانده است در میان ده دلیل اصلی مرگ در بسیاری از نقاط جهان در حال توسعه (WHO 2016). در سال 2015، سازمان جهانی بهداشت (WHO) 10.4 میلیون مورد جدید سل در جهان و 1.8 میلیون مورد مرگ را تخمین زده است، و سل را یکی از علل مرگ و میر در اثر یک عامل عفونی (WHO 2016) می داند. تعداد افرادی که عفونت های پنهان را حمل می کنند در حدود 1.7 میلیارد در سراسر جهان تخمین زده شده است، و از ابزارهای جدید تشخیصی، واکسن های بهتر و رژیم های جدید برای کنترل سل (از هوبن و داود 2016) استفاده می کنند. بسیاری از بیماری همه گیر TB، به ویژه در کشورهای جنوب صحرای آفریقا، به دلیل ابتلا به ویروس نقص ایمنی بدن انسان (HIV) همراه است که 1.2 میلیون از موارد جدید بیماری سل در سال 2015 را به خود اختصاص داده است (WHO 2016). علاوه بر این، 480،000 مورد تخمین زده شده است که توسط سل RB مقاوم به چندین دارو (MDR-TB) ایجاد شده است، و چالش های اضافی برای تشخیص و درمان (نگاه کنید به فصل 12 و 14 این کتاب).
Year: 2016
Publisher: SPRINGER
By : Sebastien Gagneux
File Information: English Language/ 319 Page / size: 5.11 MB
Only site members can download free of charge after registering and adding to the cart
سال : 1395
ناشر : SPRINGER
کاری از : سباستین گاگونوس
اطلاعات فایل : زبان انگلیسی / 319 صفحه / حجم : MB 5.11
نقد و بررسیها
هنوز بررسیای ثبت نشده است.