توضیحات
ABSTRACT
Microsatellites among Lepidoptera are poorly known. We have shown that some ISSR amplifications are possible and demonstrate their applicability in studying intra- and inter-specific variation in some Noctuid populations .The Lepidoptera are sensitive to habitat and climatic change (HARPER et al. 2000). We analyse Noctuid populations in natural and disturbed habitats in the Pyrene´es (France). We have attempted to find a versatile method that can be used in species determination, and, to demonstrate small genetic differences, in the nuclear genome of moths. Compared to other groups of animals relatively few microsatellite studies have been carried out with Lepidoptera (NE` VE and MEGLE´ CZ 2000). Only few studies involve ISSR (REDDY et al. 1999). One reason was that it has been assumed that microsatellites are lacking or are very rare in Lepidoptera. However, MEGLE´ CZ and SOLIGNAC (1998) and HARPER et al. (2000) have successfully localised (CA)n repeats in insect microsatellites. We found that: (i) (CA)n primer gives the most
informative profiles; (ii) DNA profiles between species differ substantially; (iii) comparison of ISSR profiles can be successfully applied to study intra-specific variation.
INTRODUCTION
ISSR-PCR of nuclear DNA is a PCR method to map the nuclear genome and to discover rearrangements. ISSR usually produces a genomic fingerprint that is similar to that generated by AFLP-PCR. ISSR employs a single PCR primer only. These PCR primers bind directly to microsatellites, such as (CA)n, which are abundant in eukaryotic genomes. Since sequences of microsatellites are conserved over wide ranges of organisms, ISSR-PCR can use universal primers, which do not need to be adapted to individual species as in microsatellite PCR. In ISSR-PCR stretches of DNA between adjacent microsatellite elements are amplified. Since we use a single PCR primer only, a necessary prerequisite is the inversion of a microsatellite motive in the neighbourhood (up to 2000 bp distance) of an existing microsatellite element.
چکیده
Microsatellites در میان Lepidoptera نامشخص است. ما نشان داده ایم که برخی از تقویت های ISSR امکان پذیر هستند و کاربرد آن در مطالعه تنوع درونی و بین خاص در برخی از جمعیت Noctuid را نشان می دهد. Lepidoptera به زیستگاه و تغییرات اقلیمی حساس هستند (HARPER et al.، 2000). ما جمعیت Noctuid را در زیستگاه های طبیعی و آشفته در پیرنه (فرانسه) تجزیه و تحلیل می کنیم. ما تلاش کرده ایم روش متفاوتی را پیدا کنیم که می تواند در تعیین گونه ها مورد استفاده قرار گیرد و برای نشان دادن تفاوت های ژنتیکی کوچک در ژنوم هسته ای پروانه ها. در مقایسه با گروه های دیگر حیوانات نسبتا کمی از مطالعات میکروسکوپی با Lepidoptera (NE` VE و MEGLE’CZ 2000) انجام شده است. تنها تعداد کمی از مطالعات، ISSR را شامل می شوند (REDDY et al 1999). یکی از دلایل این بود که فرض شده است که میکروسکوپیتها در Lepidoptera کمبود یا بسیار نادر هستند. با این حال، MEGLE ‘CZ و SOLIGNAC (1998) و HARPER و همکاران. (2000) با تکرار مکانهای (CA) n در میکروسلاکتین های حشرات محلی موفق بوده اند. ما متوجه شدیم که: (i) (CA) n primer به بیشترین میزان اطلاعاتی را می دهد؛ (ii) پروفایل DNA بین گونه ها اساسا متفاوت است؛ (iii) مقایسه پروفیل های ISSR را می توان با موفقیت برای مطالعه تنوع درون خاصی مورد استفاده قرار داد.
مقدمه
ISSR-PCR DNA هسته ای یک روش PCR برای نقشه برداری ژنوم هسته ای و کشف تغییرات است. ISSR معمولا یک اثر انگشت ژنومی ایجاد می کند که مشابه آن تولید شده توسط AFLP-PCR است. ISSR تنها یک پرایمر PCR را استفاده می کند. این پرایمرهای PCR مستقیما به میکروسلایت، مانند (CA) n، که در ژنومهای یوکاریوتی فراوان هستند، مستقیما متصل می شوند. از آنجایی که توالی های میکروس صوتی در محدوده وسیعی از ارگانیسم ها محافظت می شود، ISSR-PCR می تواند از پرایمرهای جهانی استفاده کند که نیازی به انطباق با گونه های مختلف مانند PCR Microsatellite نیست. در ISSR-PCR، دو قطعه DNA بین عناصر میکروسیمتیک مجاور تقویت می شوند. از آنجاییکه تنها از یک پرایمر تک PCR استفاده می کنیم، پیش نیاز لازم، معکوس شدن یک موتور ریزش موتوری در محدوده (تا 2000 bp فاصله) از عنصر میکروسیمتیک موجود است.
Year: 2002
Publisher : SPRINGER
By : C. LUQUE , L. LEGAL , H. STAUDTER , C. GERS and M. WINK
File Information: English Language/ 3 Page / size: 571 KB
Only site members can download free of charge after registering and adding to the cart
سال : 1381
ناشر : SPRINGER
کاری از : C. LUQUE، L. LEGAL، H. STAUDTER، C. GERS و M. WINK
اطلاعات فایل : زبان انگلیسی / 3 صفحه / حجم : KB 571
نقد و بررسیها
هنوز بررسیای ثبت نشده است.