توضیحات
ABSTRACT
Here, we describe the use of complementary techniques applicable to different types of samples to analyze chromosomal alterations in urothelial carcinoma. By a conventional chromosome analysis on fresh biopsies, it is possible to delineate the status of ploidy and rough chromosomal aberrations. The multi-target fluorescence in situ hybridization (FISH) UroVysion test, for the rapid detection of chromosomal aneusomy of chromosomes 3, 7, and 17 and/or deletion of 9p21 locus, is applicable to urine specimens as well as to formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) specimens and fresh biopsies. Finally, array comparative genomic hybridization (array-CGH) gives the possibility of analyzing the DNA in a single experiment from a biopsy of the tumor but also from FFPE specimens; this technique is able to detect alterations at the genome level not excluding any chromosome.
INTRODUCTION
The biological differences among the two different clinical and prognostic subtypes of transitional cell carcinoma (TCC, also urothelial cell carcinoma)—non-muscle-invasive, and muscleinvasive bladder cancers —reflect the underlying genetic heterogeneity that leads to specific pathways of tumor development and progression and they consequently influence the prognosis, the choice of treatment, and the survival rate. Innumerable studies have traced the status of known oncogenes and tumor suppressor genes and have revealed several recurring chromosomal changes associated with the pathologic stage and/or outcome of the tumor . On one hand, based on the well-known genetic alterations of bladder cancer, a multi-target fluorescence in situ hybridization (FISH) assay has been developed for the detection of TCC in urine specimens . The UroVysion FISH test, approved by the U.S. Food and Drug Administration, is based on three centromeric probes specific for chromosomes 3, 7, and 17 and a fourth probe to the 9p21 region, for the detection of chromosomal aneusomy and/or deletion of 9p21 locus, which are common genetic alterations in TCCs . On the other hand, the development of array comparative genomic hybridization (array-CGH) led to the possibility of analyzing the whole genome in a single experiment, suggesting its possible application in screening/surveillance programs of cancer patients. With the use of the high-resolution mapping of array-CGH, novel copy number alterations were identified in many small genomic regions that had not been detected in previous studies.
چکیده
در اینجا ما استفاده از تکنیک های مکمل برای نمونه های مختلف برای تجزیه و تحلیل تغییرات کروموزومی در کارسینوم اورکتیال توصیف می کنیم. با تجزیه و تحلیل کروموزوم معمول بر روی بیوپسی های تازه، می توان وضعیت پریودیت های خلفی و کروموزوم خشن را مشخص کرد. تست UroVysion برای تشخیص سریع کروموزوم Aneusomy از کروموزوم 3، 7 و 17 و / یا حذف 9p21 locus چند منظوره فلورسانس در محل hybridization (FISH) برای نمونه های ادرار و همچنین پارافین ثابت فرمالین -مجموعه (FFPE) نمونه ها و بیوپسی های تازه. در نهایت، هیبریداسیون ژنومی آرایه (array-CGH) امکان تجزیه و تحلیل DNA را در یک آزمایش واحد از بیوپسی تومور، بلکه همچنین از نمونه های FFPE فراهم می کند؛ این تکنیک قادر به تشخیص تغییرات در سطح ژنوم است که هر کروموزوم را رد می کند.
مقدمه
اختلافات بیولوژیکی بین دو نوع مختلف کلینیکی و پیش آگهی کارسینوم سلول گذار (کارسینوم TCC و همچنین سلول های تومور سلولی) – غیر عصبی – تهاجمی و سرطان مثانه – عصبی – بازتاب ناهمگونی ژنتیکی زیرزمینی است که منجر به مسیرهای خاص رشد و پیشرفت تومور می شود و در نتیجه آنها پیش آگهی، انتخاب درمان و میزان بقا را تحت تاثیر قرار می دهد. مطالعات بی شماری وضعیت ژنهای سرکوبگر شناخته شده Oncogenes و ژن های تومور را شناسایی کرده اند و چندین تغییرات کروموزوم مجدد در ارتباط با مرحله پاتولوژیک و / یا نتیجه تومور نشان داده اند. از یک طرف، بر اساس تغییرات شناخته شده ژنتیکی سرطان مثانه، برای تشخیص TCC در نمونه های ادرار، یک آزمایش چندتایی (Hybridization) در محل آزمایش (FISH) فلورسانس چند هدفه ایجاد شده است. آزمایش UroVysion FISH که توسط اداره غذا و داروی آمریکا تایید شده است، بر اساس سه پروب سنوموریک خاص برای کروموزوم های 3، 7 و 17 و یک پروب چهارم به منطقه 9p21 برای تشخیص آنیوسومی کروموزومی و / یا حذف 9p21 لوسوس که تغییرات ژنتیکی مشترک در TCC ها است. از سوی دیگر، توسعه ترکیبی ژنومی آرایه ای (array-CGH) منجر به امکان تجزیه و تحلیل کل ژنوم در یک آزمایش واحد می شود که نشان می دهد کاربرد آن در برنامه های غربالگری / نظارت بر بیماران سرطانی. با استفاده از نقشه برداری با وضوح بالا array-CGH، تغییرات نسخه جدید رکورد در بسیاری از مناطق ژنومی کوچک شناسایی شده است که در مطالعات قبلی شناسایی نشده است.
Year: 2016
Publisher: SPRINGER
By : Wolfgang A. Schulz, Michèle J. Hoffmann,and G€unter Niegisch
File Information: English Language/ 271 Page / size: 5.76 MB
Only site members can download free of charge after registering and adding to the cart
سال : 1395
ناشر : SPRINGER
کاری از : ولفگانگ آ. شولز، میشل جی. هافمن، و نگیشچ
اطلاعات فایل : زبان انگلیسی / 271 صفحه / حجم : MB 5.76
نقد و بررسیها
هنوز بررسیای ثبت نشده است.