توضیحات
ABSTRACT
Over 98% of our genome is non-coding and is now recognised to have a major role in orchestrating the tissue specific and stimulus inducible gene expression pattern which underpins our wellbeing and mental health. The non-coding genome responds functionally to our environment at all levels, encompassing the span from psychological to physiological challenge. The gene expression pattern, termed the transcriptome, ultimately gives us our neurochemistry. Therefore a major modulator of mental wellbeing is how our genes are regulated in response to life experiences. Superimposed on the aforementioned non-coding DNA framework is a vast body of genetic variation in the elements that control response to challenges. These differences, termed polymorphisms, allow for a differential response from a specific DNA element to the same challenge thus potentially allowing ‘individuality’ in the modulation of our transcriptome. This review will focus on a fundamental mechanism defining our psychological and psychiatric wellbeing, namely how genetic variation can be correlated with differential gene expression in response to specific challenges, thus resulting in altered neurochemistry which consequently may shape behaviour.
INTRODUCTION
The human genome has evolved to include a combination of both highly conserved regions of regulatory non-coding DNA (ncDNA) found across many species and humanspecific regulatory DNA elements which together act to regulate expression of mRNA. This combination of DNA elements allows determination of where, when, how much and for how long, genes are expressed in the human brain in response to normal developmental, psychological and physiological cues, Figure 1. Many of these elements exhibit genetic variation which is not only associated with risk for a specific condition, but has also been demonstrated to alter the regulatory properties of the gene. The functional interpretation and analysis of ncDNA variation can be initially addressed in silico by overlaying its position on databases containing characterised and predicted functional elements within the genome, Box 1. The most easily accessible free database is the Encyclopaedia of DNA Elements (ENCODE; https://www.encodeproject.org/) which is a collaboration of research groups funded by the National Human Genome Research Institute , this can be used in combination with a plethora of other database browsers such as the University of California Santa Cruz (UCSC) Genome Browser (http://genome.ucsc.edu/ ) .
چکیده
بیش از 98٪ از ژنوم ما غیر رمزگذاری است و در حال حاضر شناخته شده است که نقش مهمی در ارکستر بافت خاص و محرک القاء الگوی بیان ژن که پایه سلامت ما و سلامت روان است. ژنوم غیر کدینگ به طور محسوس به محیط ما در تمام سطوح واکنش نشان می دهد و شامل محدوده ای از چالش روانی و فیزیولوژیکی می شود. الگوی بیان ژن، که ترانسکتوموم نامیده می شود، در نهایت به ما عصبی می دهد. بنابراین یک مدولاتور اصلی رفاه ذهنی این است که چگونه ژن های ما در پاسخ به تجربیات زندگی تنظیم می شوند. در چارچوب DNA غيرکديوي فوق ذکر شده، مجموعه گسترده اي از تنوع ژنتيکي در عناصري است که پاسخ به چالش ها را کنترل مي کند. این تفاوت ها، به نام پلی مورفیسم، اجازه می دهد تا یک پاسخ دیفرانسیلی از عنصر خاص DNA به همان چالش اجازه می دهد که به طور بالقوه اجازه می دهد “فردیت” در مدولاسیون ترانسکتوموم ما. این بررسی بر روی یک مکانیسم اساسی تعریف سلامت روان شناختی و روانی ما تمرکز می کند، یعنی اینکه چگونه تنوع ژنتیکی می تواند با بیان بیان ژن دیفرانسیل در پاسخ به چالش های خاص مرتبط شود، در نتیجه موجب تغییر در نورو شیمیایی می شود که در نتیجه می تواند رفتار را شکل دهد.
مقدمه
ژنوم انسان تکامل یافته است تا ترکیبی از دو منطقه بسیار محافظت شده از DNA غیر تنظیم کننده تنظیم کننده (ncDNA) موجود در بسیاری از گونه ها و عناصر DNA مشخص کننده انسان مشخص که با هم برای تنظیم بیان mRNA. این ترکیبی از عناصر DNA اجازه می دهد تعیین زمانی که، چه مقدار، و چه مدت، ژن ها در مغز انسان در پاسخ به نشانه های رشد طبیعی، روانی و فیزیولوژیک بیان شده است، شکل 1. بسیاری از این عناصر تنوع ژنتیکی را نشان می دهد که نیست تنها با خطر برای یک وضعیت خاص همراه است، اما همچنین نشان داده شده است که خواص تنظیم کننده ژن را تغییر دهید. تفسیر عملکرد و تجزیه و تحلیل تنوع ncDNA در ابتدا در سیلیکو می تواند با قرار دادن موقعیت خود در پایگاه داده های حاوی عناصر عملکردی پیش بینی شده درون ژنوم، جعبه 1. در پایگاه داده آزادانه ترین دسترسی، دایره المعارف عناصر DNA (ENCODE؛ https: //www.encodeproject.org/) که همکاری گروه های تحقیقاتی است که توسط موسسه تحقیقاتی ژنوم ملی انستیتو تامین می شود، می توان آن را با ترکیبی از مرورگرهای پایگاه داده دیگر مانند دانشگاه کالیفرنیا سانتا کروز (UCSC) Genome مرورگر (http://genome.ucsc.edu/).
Year: 2018
Publisher : ELSEVIER
By : John P Quinn, Abigail Savage, Vivien J Bubb
File Information: English Language/ 16 Page / size: 445 KB
سال : 1397
ناشر : ELSEVIER
کاری از : جان پین Quinn، Abigail Savage، Vivien J Bubb
اطلاعات فایل : زبان انگلیسی / 16 صفحه / حجم : KB 445
نقد و بررسیها
هنوز بررسیای ثبت نشده است.